В сезоне 2009-2010 «Черноморец» покинул Премьер-лигу. Так как в первой лиге нет турнира дублирующих составов, молодёжь «Черноморца» заявилась на сезон 2010-2011 во вторую лигу под старым именем «Черноморец-2».

Достижения:

В чемпионатах Украины
Сезоны 1992 – 1994/95, 1999/00 – 2003/04: 300 игр, 77 побед, 69 ничьих, 154 поражения, разность мячей 279 – 405.
Наивысшее достижение – 17 место в первой лиге (1999/00),
6 место во второй лиге (2002/03).
Самая крупная победа – 5:0 («Торпедо» Запорожье в 2002/03).
Самое крупное поражение – 0:6 («Титан» Армянск в 2000/01).
Больше всего игр провел – Геннадий Щекотилин (113).
Лучший бомбардир – Александр Козакевич – 23 мяча.

В розыгрышах Кубка Украины
Турниры 1992/93 - 1994/95, 2000/01: 6 игр, 2 победы, 4 поражения, разность мячей 3 – 10.
Наивысшее достижение - выход в 1/32 финала (1994/95).
Самая крупная победа – 1:0 («Нива» Нечаяное и «Металлург» Никополь в 1994/95).
Самое крупное поражение – 1:4 («Артания» Очаков в 1992/93).
Больше всего игр провел – Георгий Мельников (5).
По одному мячу забили – Александр Козакевич, Георгий Мельников и Юрий Селезнев.

football.odessa.ua